7月3日上午，卫生部与上海市人民政府正式签订《进一步深化部市合作协议书》和《共建共管在沪卫生部管理单位补充协议》。卫生部部长陈竺，上海市委副书记、市长韩正出席会议并讲话，共同签署相关协议。上海市副市长沈晓明主持会议。

　　陈竺在讲话中指出，医改实施两年多来，有序推进五项重点改革，取得了明显进展和初步成效，人民群众已从中得到实惠，但也应清醒地认识到，医改面临的形势依然紧迫。要实现医改的各项目标，必须坚持保基本、强基层、建机制，必须充分发挥各地的积极性和创造性，鼓励和支持各地从实际出发积极探索，率先在一些关键领域取得突破，积累经验。希望通过建立部市合作这种工作机制，充分调动中央和地方积极性，充分发挥上海的优势和特色，共同探索创新，为全国深化医疗卫生体制改革工作创造更多经验。

　　韩正指出，部市合作机制，是国家指导地方发展、地方服务国家战略的一项创新举措。卫生部与上海正式建立部市合作机制，将对上海卫生事业发展产生重要而深远的影响。上海要紧紧依托部市合作机制，大力推进医药卫生体制改革，积极服务国家医改战略。要不断在实践中总结和提炼经验，目标是建立起符合国情和地方特点、人民群众得实惠、充分调动广大医务工作者积极性的医药卫生体制。与此同时，上海要紧紧依托部市合作机制，加强对在沪卫生部管理单位共建共管，更好地服务全国；

　　要紧紧依托部市合作机制，进一步提高医学科技水平，努力建设成为亚洲医学中心城市和健康城市之一。

　　据悉，2009年，卫生部和上海市政府签署了《共建共管在沪卫生部管理医院协议》，两年多来，部市合作取得了明显成效，上海市政府持续加大对部管医院的支持力度，部管医院更加积极地参与上海医疗卫生改革，服务上海群众的健康。此次签署的《进一步深化部市合作协议书》，标志着合作共建进一步深化，内容更加丰富，不仅在部管医院上，还拓展到医疗服务、公共卫生、中医药、食品药品监管、医学科研人才、卫生信息化等各方面。此次卫生部与上海市政府还签署了《共建共管在沪卫生部管理单位补充协议》，进一步共建寄生虫病预防控制所，提高我国疾病预防控制及科学研究的综合实力，提升上海市疾控工作的整体水平，为全国热带病防治事业作出贡献。